多平臺、多方法RNA文庫構(gòu)建

RNA是以DNA的一條鏈為模板，以堿基互補配對原則，轉(zhuǎn)錄而形成的一條單鏈，主要功能是實現(xiàn)遺傳信息在蛋白質(zhì)上的表達，是遺傳信息傳遞過程中的橋梁，主要存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中。

眾所周知，total RNA中95%以上都是核糖體RNA（rRNA），可rRNA卻非常保守，在不同的組織、器官當中的表達極度穩(wěn)定； 而只占total RNA總量2%-3%的mRNA在RNA當中信息含量卻最為豐富，因此mRNA成為人們在科學研究中的重要關(guān)注點。

組織或細胞總RNA中各種RNA分布餅狀圖

而某個物種的特定組織或細胞在某一生理功能狀態(tài)下發(fā)生的mRNA產(chǎn)物的轉(zhuǎn)錄，即轉(zhuǎn)錄組，是基因組遺傳信息傳遞和表達的重要步驟和過程。

通過高通量mRNA測序可以獲得大量轉(zhuǎn)錄本序列信息，定量基因轉(zhuǎn)錄表達水平，獲得基因組轉(zhuǎn)錄區(qū)域及其位點信息等，在基因組序列拼接注釋、樣品間基因轉(zhuǎn)錄差異表達及其功能研究等方面有重要作用?？蓮恼w水平研究基因功能以及基因結(jié)構(gòu)，揭示特定生物學過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機理，已被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。

RNA樣本的建庫質(zhì)量對于后續(xù)上機測序至關(guān)重要，可直接影響后續(xù)結(jié)果的分析。因此，一個好的建庫試劑盒對于RNA測序至關(guān)重要。全式金目前已推出3款RNA建庫試劑盒，分別適用于Illumina和MGI平臺，均具有高數(shù)據(jù)質(zhì)量、高文庫轉(zhuǎn)化率的特點。

常規(guī)RNA建庫

? TransNGS^? RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina^?

本產(chǎn)品是針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的可用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，在5 h之內(nèi)可將1-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。

● 文庫構(gòu)建原理示意圖

● 與競品的比較

1 μg、100 ng 人血總RNA樣品去除rRNA后(TransGen, KD101)，分別使用TransGen、Company N和Company V建庫產(chǎn)品進行建庫測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量、基因表達水平以及相關(guān)性方面與競品相比，性能一致。

? 測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

? 比對區(qū)域分布

? 基因表達及差異分析

? 相關(guān)性分析

快速RNA建庫  

?  TransNGS^? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for Illumina^? 

本產(chǎn)品是針對Illumina高通量測序平臺開發(fā)的專用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復(fù)與加A反應(yīng)，中間不需要純化步驟，極大地簡化了操作流程，縮短了建庫時間，可在4 h之內(nèi)將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。

● 文庫構(gòu)建原理示意圖

● 與競品的比較

使用 mRNA 純化試劑盒對人、小鼠、小麥和煙草的總RNA進行mRNA捕獲，其中人和小鼠投入200 ng總RNA，小麥和煙草投入1000 ng總RNA；分別使用TransGen和Company V建庫試劑盒進行RNA文庫構(gòu)建，文庫分選后檢測文庫產(chǎn)量、峰型，并進行測序分析。

? 文庫產(chǎn)量

? 建庫峰型

?測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

?相關(guān)性分析

?   TransNGS^? Fast RNA-Seq Library Prep Kit for MGI^?

本產(chǎn)品是針對MGI高通量測序平臺開發(fā)的專用于構(gòu)建鏈特異性或非鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫的試劑盒，可一步完成二鏈合成、末端修復(fù)與加A反應(yīng)，中間不需要純化步驟，極大地簡化了操作流程，縮短了建庫時間，可在4 h之內(nèi)將0.1 ng-100 ng處理后的RNA構(gòu)建成高質(zhì)量的測序文庫，得到的文庫產(chǎn)量高、信息完整。

● 文庫構(gòu)建原理示意圖

● 與競品的比較

使用mRNA純化試劑盒對人、小鼠和擬南芥的總RNA進行mRNA捕獲，其中人和小鼠投入200 ng總RNA，擬南芥投入1000 ng總RNA；分別使用TransGen和Company V建庫試劑盒進行RNA文庫構(gòu)建，文庫分選后檢測文庫產(chǎn)量、峰型，并進行測序分析。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品與Company V產(chǎn)品性能一致。

?文庫產(chǎn)量

?建庫峰型

?測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

?相關(guān)性分析

相關(guān)產(chǎn)品推薦

?   TransNGS^? rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

●產(chǎn)品特點   

? 可有效去除人/小鼠/大鼠高達99%的ribosomal RNA。

? 提供Control qPCR Primer Sets，檢測去除前后ribosomal RNA和非ribosomal RNA含量的變化。

●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

1 μg人(Human, H)、小鼠(Mouse, M)和大鼠(Rat, R)總RNA樣品，分別使用TransGen和Company K產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致，甚至優(yōu)于競品。

? TransNGS^? rRNA Depletion Kit (Bacteria)

●產(chǎn)品特點   

? 可有效去除各種細菌高達99%的ribosomal RNA。

? 操作簡便。

●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

2 μg大腸桿菌(Escherichia coli, E. coli)總RNA樣品，分別使用TransGen、Company V和Company I產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致。

● 成功測試菌種 (rRNA Rate < 5%)

? TransNGS^? rRNA Depletion Kit (Animal)

●產(chǎn)品特點   

? 可有效去除各種動物高達99%的ribosomal RNA。

? 操作簡便。

●測序數(shù)據(jù)質(zhì)量

2 μg斑馬魚(Zebra fish, Zebra) 總RNA樣品，分別使用TransGen和Company I產(chǎn)品去除rRNA后，進行建庫(TransGen, KP601)測序及分析，結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品在測序數(shù)據(jù)質(zhì)量上與競品相比，性能一致。

●成功測試物種 (rRNA Rate < 10%)

?  MagicPure^? mRNA Kit

●產(chǎn)品特點   

? 操作簡單。

?提取mRNA得率高，純度高。

?適用于磁棒式高通量核酸提取儀。

●文庫產(chǎn)量

分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對人、大鼠、小鼠、煙草、百合、番茄、大豆、擬南芥、小麥和水稻的總RNA進行mRNA捕獲，其中人、大鼠和小鼠投入200 ng總RNA，其他物種投入1000 ng總RNA；使用建庫試劑盒 (TransGen, KP701) 進行RNA文庫構(gòu)建后檢測文庫產(chǎn)量。

產(chǎn)品信息